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不同分類依據(jù)下,基因芯片包含哪些種類

五度易鏈 2019-01-28 2574 74

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 雖然我國(guó)關(guān)于基因芯片還處在研究階段,但是已經(jīng)有不少機(jī)構(gòu)取得了相關(guān)研究的進(jìn)展。這些進(jìn)展也代表著我國(guó)的基因研究具有了一定的水平。


  雖然我國(guó)關(guān)于基因芯片還處在研究階段,但是已經(jīng)有不少機(jī)構(gòu)取得了相關(guān)研究的進(jìn)展。這些進(jìn)展也代表著我國(guó)的基因研究具有了一定的水平。

  基因芯片類型較為繁多,可以依據(jù)不同的分類方法進(jìn)行分類,一般可分為以下幾種:

  1、按照載體上所添加DNA種類的不同,基因芯片可分為寡核苷酸芯片和cDNA芯片兩種:寡核苷酸芯片一般以原位合成的方法固定到載體上,具有密集程度高、可合成任意系列的寡核苷酸等優(yōu)點(diǎn),適用于DNA序列測(cè)定、突變檢測(cè)、SNP分析等;其缺點(diǎn)是合成寡核苷酸的長(zhǎng)度有限,因而特異性較差,而且隨著長(zhǎng)度的增加,合成錯(cuò)誤率增加。寡核苷酸芯片也可通過預(yù)合成點(diǎn)樣制備,但固定率不如cDNA芯片高,寡核苷酸芯片主要用于點(diǎn)突變檢測(cè)和測(cè)序,也可用作表達(dá)譜研究。cDNA芯片是將微量的cDNA片段在玻璃等載體上按矩陣密集排列并固化,其基因點(diǎn)樣密度雖不及原位合成寡核苷酸芯片高,但比用傳統(tǒng)載體的點(diǎn)樣密度要高得多,cDNA芯片最大的優(yōu)點(diǎn)是靶基因檢測(cè)特異性非常好,主要用于表達(dá)譜研究。

  2、按照載體材料分類:載體材料可分為無機(jī)材料和有機(jī)材料兩種,無機(jī)材料有玻璃、硅片、陶瓷等,有機(jī)材料由有機(jī)膜、凝膠等。膜芯片的介質(zhì)主要采用的是尼龍膜,其陣列密度比較低,用到的探針量較大,檢測(cè)的方法主要是用放射性同位素的方法,檢測(cè)的結(jié)果是一種單色的結(jié)果。而以玻璃為介質(zhì)的芯片,陣列密度高,所用的探針量少,檢測(cè)方法具有多樣性,所得結(jié)果是一種彩色的結(jié)果,與膜芯片相比,結(jié)果分辨率更高一些,分析的靈活性更強(qiáng)。

  3、按照點(diǎn)樣方式的不同可以分為原位合成芯片、微矩陣芯片、電定位芯片三種。

  基因芯片有哪些特點(diǎn)

  1、高通量、多參數(shù)同步分析。現(xiàn)在的基因芯片制作工藝能夠達(dá)到在1cm2的載體平面上固定數(shù)萬至數(shù)十萬的探針,實(shí)現(xiàn)對(duì)樣品中數(shù)量巨大的相關(guān)基因,甚至整個(gè)基因組及信息的同步檢測(cè)和分析。

  2、快速全自動(dòng)分析。在一定的條件下使樣品中的靶基因片段同時(shí)與芯片的多個(gè)探針進(jìn)行雜交,并采用掃描儀器測(cè)量雜交信號(hào)和分析處理數(shù)據(jù)。基因芯片能夠,從根本上提高了測(cè)量工作的速度和效率,降低了當(dāng)前測(cè)量工作的強(qiáng)度和難度。

  3、高精確度分析。我們能夠?qū)π酒系拿恳稽c(diǎn)都進(jìn)行精確得定位和選址,同時(shí)每個(gè)探針都能夠進(jìn)行精確的設(shè)計(jì)和制備,能夠精確檢測(cè)出不同的靶基因、同一靶基因不同的狀態(tài)以及在一個(gè)堿基上的差別。

  4、高精密度分析。商品化芯片制作上的精密及檢測(cè)試劑和方法上的統(tǒng)一同時(shí)也提高了芯片檢測(cè)的高精密度和重現(xiàn)性,我們能夠使用不同批次乃至不同實(shí)驗(yàn)室之間的檢測(cè)結(jié)果,進(jìn)行有效比對(duì)及分析。

  5、高靈敏度分析。基因芯片采用了不容易發(fā)生擴(kuò)散作用的載體,探針及樣品靶基因的的雜交點(diǎn)非常集中,加上雜交前樣品靶基因的擴(kuò)增和雜交后檢測(cè)信號(hào)的擴(kuò)張,提高了檢測(cè)的靈敏度,可以檢測(cè)出1個(gè)細(xì)胞中低至1個(gè)拷貝的靶基因,從而使檢測(cè)所需的樣品量大幅度減少,一般只需要10~20μL樣品。

  作為一個(gè)新的產(chǎn)業(yè)方向,基因芯片的研究和計(jì)算機(jī),生命科學(xué)和機(jī)械研究方面的知識(shí)分不開,而后期的研究還需要不斷增加人才和研究方面的投入。


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